מועצת רשות הנמלים והרכבות בראשות גד יעקבי, אישרה מתן פטור והנחות מתשלום אגרות נמלים שונות לתקופת השביתה והעיצומים שנקטה ההסתדרות, אשר כללו גם את נמלי הים והמכס.
על פי החלטת מועצת הרשות ינתן פטור מתשלום אגרות מינגש לפרק הזמן בו המתינו אוניות בנמלים במהלך השביתה, ולא טופלו . לאוניות שטופלו במהלך העיצומים, תינתן הנחה בשיעור של 50% מאגרות המינגש. מועצת הרשות החליטה בנוסף על מתן הנחה בשיעור של 50% מאגרות אחסנה למטענים שהמתינו בנמלי הים באותה תקופה. ההנחה תחול על מטענים ששוחררו מהנמל או נטענו לאוניות , בתקופת השביתה והעיצומים ובתוך שבוע לאחריה.

עמוס רון, מנכ"ל רשות הנמלים והרכבות אמר כי הרשות ועובדיה עושים ככל יכולתם למזער רטרואקטיבית את נזקי השביתה והעיצומים במכס ובנמלים. הפטורים וההנחות מתשלום האגרות הם חלק אחד ממכלול פעולות שעשתה הרשות ובכלל זה, סיום מהיר , שנעשה בתוך ארבעה ימים, של תור ההמתנה בנמלים בגלל ההשביתה , כתוצאה מהאצת הפעילות ותגבור משמרות.