נמל אלכסנדריה הוא הנמל ה-58 במספר המצטרף ליוזמת אבטחת המכולות לאחר שממשלת מצרים חתמה ביוני 2006 על מזכר הבנות בעניין עם רשות המכס של ארה"ב
במצרים הובאה בהבלטה הודעתו של המשרד לביטחון פנים של ארצות הברית כי החליט לאחרונה לכלול את נמל אלכסנדריה ביוזמת ביטחון המכולות, היוזמה אותה הפעילה ארצות הברית במטרה לאבטח ולבדוק את המכולות אשר יעדן נמלי הים של ארצות הברית על מנת למנוע הברחת חומרים מסוכנים או נשק.
רשות המכס וההגנה על גבולות ארצות הברית הודיעה כי נמל אלכסנדריה הוא הנמל ה-58 במספר המצטרף ליוזמת אבטחת המכולות, הידועה גם כיוזמת CSI. ממשלת מצרים חתמה ביוני 2006 על מזכר הבנות עם רשות המכס של ארצות הברית בדבר הכנסת נמל אלכסנדריה ליוזמה.
על פי הדיווחים, בעקבות היוזמה לאבטחת מכולות הגיע מספר המכולות המגיעות לארצות הברית דרך 58 הנמלים המשתתפים ביוזמה ל-85% מכלל המכולות הנכנסות לארצות הברית ממדינות צפון אמריקה, מרכז אמריקה ודרומה, אירופה, אסיה, אפריקה והעולם הערבי.